人類の起源

私たちのDNAにネアンデルタール人は何%入っている?

2026年10月28日更新・約9分で読めます

ネアンデルタール人の頭骨(ベルリン新博物館)
Photo: Gary Todd / CC0 / Wikimedia Commons
AIによる調査論文と博物館・研究機関の資料をAIが調べ、内容を確かめて整理しました(出典は末尾)。

日本人を含め、アフリカの外にルーツを持つ人のDNAには、すでにいなくなった人類のかけらが混ざっています。その割合は約2%。100ページの本なら2ページ分です。数字の出し方と、交わった時期を順に見ていきます。

3行でわかる

  1. アフリカの外にルーツを持つ人のDNAの約1.8〜2.6%は、ネアンデルタール人から受け継いだもの(2017年の推定)。
  2. 交わった時期は、おもに約5万〜4万5000年前の一続きの期間と推定されている。
  3. 別の人類デニソワ人のDNAも、メラネシアの人々などに受け継がれている。

01 わかっていること私たちのDNAのうちネアンデルタール人の分は何%?

アフリカの外にルーツを持つ人では、全体の約1.8〜2.6%です。2010年の最初の推定は1〜4%で、その後、質のよいゲノムが読まれて幅が狭まりました。

ネアンデルタール人は、ヨーロッパから西アジアにかけて暮らしていた人類です。私たちホモ・サピエンスとは別のなかまですが、出会ったときに子どもを残していました。

サハラ砂漠より南のアフリカの人は、アフリカの外の人ほどネアンデルタール人と共通する部分を持っていません。出会いが主にアフリカの外で起きたためと考えられています。

この割合は、どの集団が優れているかとは関係ありません。祖先がたどった道のりの違いが、DNAに記録として残っているだけです。

02 どうやってわかったのかどうやって何%とわかったの?

数万年前の骨から取り出したDNAを読み、今の人のDNAと比べました。読める骨が増えるたびに、割合と交わった時期の推定が細かくなっています。

わかっているGreen ら(2010年、Science)[1]

ネアンデルタール人のゲノム(全遺伝情報)の下書きを初めて読み、アフリカの外の人のゲノムの1〜4%がネアンデルタール人由来と推定した。

どうやって: 3人分の骨から40億文字以上のDNAを読み、世界の各地の現代人5人と比べた。アフリカの外の人とだけ共通する部分が多かった。

わかっているPrüfer ら(2017年、Science)/マックス・プランク研究所の発表[3,7]

クロアチアのヴィンディヤ洞窟の女性(約5万年前)のゲノムを高い精度で読み、アフリカの外の人の1.8〜2.6%がネアンデルタール人由来と推定した。

どうやって: この女性は、私たちの祖先と交わった集団に近かった。そのため、今の人のDNAの中からネアンデルタール人由来の部分を10〜20%多く見つけられるようになった。

わかっているReich ら(2010年、Nature)[4]

シベリアのデニソワ洞窟の指の骨から、ネアンデルタール人に近い別の人類「デニソワ人」を見つけた。今のメラネシアの人のゲノムの4〜6%がデニソワ人由来と推定した。

どうやって: 骨の形ではなく、小さな指の骨のDNAだけで新しい人類のなかまを見分けた。

わかっているIasi ら(2024年、Science)/Sümer ら(2025年、Nature)[5,6]

交わった時期は、約5万500〜4万3500年前の一続きの期間に集中していた(Iasiら)。ドイツの約4万5000年前の人骨からは、約4万9000〜4万5000年前という推定も出た(Sümerら)。

どうやって: ネアンデルタール人由来のDNAのかけらは、世代を重ねるほど短く切れていく。その長さを、過去5万年の300人以上のゲノムで測って時期を逆算した。

2012年のSankararamanらの研究は、交わった時期を3万7000〜8万6000年前と広く見積もっていました(もっともありそうなのは4万7000〜6万5000年前)[2]。古い人骨のDNAが増えて、幅がぐっと狭まったことになります。

03 数字と例えでいうと約2%ってどれくらい?

100ページの本なら約2ページ分です。少なく見えますが、ネアンデルタール人がいなくなった今も、その一部が多くの人の体の中に残っているということです。

項目値身近な例えでいうと
アフリカの外の人のネアンデルタール人由来1.8〜2.6% [7]100ページの本で約2〜2.6ページ
最初の推定(2010年)1〜4% [1]同じ本で1〜4ページ。幅が広かった
メラネシアの人のデニソワ人由来4〜6%(2010年の推定)[4]100ページの本で4〜6ページ
交わった時期約5万500〜4万3500年前 [5]地球の歴史を1年にすると大みそかの23時54分ごろ

時刻の例えは、5万÷46億×1年(52万5600分)=約5.7分で計算しました。大みそかの真夜中の約6分前です。

04 まだわかっていないことまだ謎なのは何?

交わった場所がどこだったか、ネアンデルタール人がなぜ姿を消したのか、デニソワ人がどんな姿だったかは、まだよくわかっていません。

05関連する記事

06よくある質問

日本人もネアンデルタール人のDNAを持っていますか?

はい。アフリカの外にルーツを持つ人は、地域を問わずネアンデルタール人由来のDNAを持つと推定されています。2017年の推定では全体の約1.8〜2.6%です。

ネアンデルタール人のDNAが多いと何か違いがありますか?

割合は人の価値や能力の優劣を示すものではありません。一部の部分がコレステロールの値や病気のなりやすさに関わるという報告はありますが、多くの部分の働きはまだわかっていません。

ネアンデルタール人と交わったのはいつですか?

約5万500〜4万3500年前の一続きの期間に集中していたと推定されています(Iasiら、2024年)。別の研究では約4万9000〜4万5000年前とされています。

出典

  1. Green RE, et al. (2010). A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328, 710-722. https://doi.org/10.1126/science.1188021
  2. Sankararaman S, Patterson N, Li H, Pääbo S, Reich D (2012). The Date of Interbreeding between Neandertals and Modern Humans. PLoS Genetics 8, e1002947. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002947
  3. Prüfer K, et al. (2017). A high-coverage Neandertal genome from Vindija Cave in Croatia. Science 358, 655-658. https://doi.org/10.1126/science.aao1887
  4. Reich D, et al. (2010). Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia. Nature 468, 1053-1060. https://doi.org/10.1038/nature09710
  5. Iasi LNM, et al. (2024). Neanderthal ancestry through time: Insights from genomes of ancient and present-day humans. Science 386, eadq3010. https://doi.org/10.1126/science.adq3010
  6. Sümer AP, et al. (2025). Earliest modern human genomes constrain timing of Neanderthal admixture. Nature 638, 711-717. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08420-x
  7. Max Planck Society (2017). Researchers sequence a new Neandertal genome. https://www.mpg.de/11515535/neandertaler-genome-croatia